/* ==========================================================================
   Cerebrum Noctis Component Classes
   Dark clinical aesthetic. Sharp corners, cyan accents, dark surfaces.
   ========================================================================== */

/* ---------- Container ---------- */

.container {
  max-width: var(--max-width);
  margin-left: auto;
  margin-right: auto;
  padding-left: var(--space-6);
  padding-right: var(--space-6);
}

.container-narrow {
  max-width: var(--max-width-narrow);
  margin-left: auto;
  margin-right: auto;
  padding-left: var(--space-6);
  padding-right: var(--space-6);
}

/* ---------- Site Nav ---------- */

.site-nav {
  position: sticky;
  top: 0;
  left: 0;
  right: 0;
  z-index: 50;
  background: var(--color-surface);
  border-bottom: 1px solid var(--color-border);
  padding: var(--space-3) 0;
}

.nav-brand {
  font-family: var(--font-mono);
  font-size: 1.125rem;
  font-weight: 700;
  color: var(--color-text);
  text-decoration: none;
  letter-spacing: -0.02em;
}

.nav-links a {
  color: var(--color-text-secondary);
  text-decoration: none;
  font-family: var(--font-sans);
  font-size: var(--text-sm);
  font-weight: 500;
  transition: color var(--duration-fast) var(--ease-default);
}

.nav-links a:hover {
  color: var(--color-primary);
}

.nav-cta {
  display: inline-flex;
  align-items: center;
  padding: var(--space-2) var(--space-5);
  background-color: var(--color-primary);
  color: var(--color-deepest);
  font-family: var(--font-sans);
  font-size: var(--text-sm);
  font-weight: 600;
  border-radius: var(--radius-md);
  text-decoration: none;
  border: none;
  cursor: pointer;
  transition: background-color var(--duration-fast) var(--ease-default);
}

.nav-cta:hover {
  background-color: var(--color-primary-hover);
}

.nav-mobile-panel {
  background: var(--color-surface);
  border: 1px solid var(--color-border);
  border-radius: var(--radius-md);
  margin-top: var(--space-3);
  padding: var(--space-3);
  box-shadow: var(--shadow-lg);
}

.nav-mobile-panel a {
  display: block;
  padding: var(--space-3);
  border-radius: var(--radius-sm);
  color: var(--color-text-secondary);
  text-decoration: none;
  font-family: var(--font-sans);
  font-weight: 500;
}

.nav-mobile-panel a:hover {
  background: var(--color-surface-raised);
  color: var(--color-primary);
}

/* ---------- Site Footer ---------- */

.site-footer {
  background-color: var(--color-deepest);
  color: var(--color-text);
  padding: var(--section-sm) 0;
  margin-top: var(--section-sm);
  border-top: 1px solid var(--color-border);
}

.site-footer .footer-brand {
  font-family: var(--font-mono);
  font-size: var(--text-xl);
  font-weight: 700;
}

.site-footer .footer-tagline {
  color: rgba(255,255,255,0.4);
  font-size: var(--text-sm);
  font-family: var(--font-mono);
  margin-top: var(--space-2);
}

.site-footer h4 {
  font-family: var(--font-mono);
  font-size: var(--text-xs);
  font-weight: 600;
  letter-spacing: 0.08em;
  text-transform: uppercase;
  color: rgba(255,255,255,0.3);
  margin-bottom: var(--space-3);
}

.site-footer a {
  color: rgba(255,255,255,0.6);
  text-decoration: none;
  transition: color var(--duration-fast) var(--ease-default);
}

.site-footer a:hover {
  color: var(--color-primary);
}

.site-footer .footer-legal {
  color: rgba(255,255,255,0.35);
  font-size: var(--text-sm);
}

.site-footer .footer-divider {
  border-top: 1px solid var(--color-border);
}

.site-footer .footer-powered {
  color: rgba(255,255,255,0.3);
  font-size: var(--text-xs);
}

.site-footer .footer-powered a {
  color: rgba(255,255,255,0.5);
}

.site-footer .footer-powered a:hover {
  color: var(--color-primary);
}

/* ---------- Form Elements ---------- */

.form-input {
  width: 100%;
  padding: var(--space-3) var(--space-4);
  border-radius: var(--radius-md);
  border: 1px solid var(--color-border-strong);
  background: var(--color-surface);
  color: var(--color-text);
  font-family: var(--font-sans);
  font-size: var(--text-sm);
  outline: none;
  transition: border-color var(--duration-fast) var(--ease-default),
              box-shadow var(--duration-fast) var(--ease-default);
}

.form-input:focus {
  border-color: var(--color-primary);
  box-shadow: 0 0 0 2px rgba(34, 211, 238, 0.15);
}

.form-input::placeholder {
  color: var(--color-muted);
}

.form-select {
  padding: var(--space-2) var(--space-4);
  border-radius: var(--radius-md);
  border: 1px solid var(--color-border-strong);
  background: var(--color-surface);
  color: var(--color-text);
  font-family: var(--font-sans);
  font-size: var(--text-sm);
  outline: none;
  transition: border-color var(--duration-fast) var(--ease-default),
              box-shadow var(--duration-fast) var(--ease-default);
}

.form-select:focus {
  border-color: var(--color-primary);
  box-shadow: 0 0 0 2px rgba(34, 211, 238, 0.15);
}

.form-checkbox {
  accent-color: var(--color-primary);
}

/* ---------- Upload Drop Zone ---------- */

.upload-dropzone {
  display: block;
  width: 100%;
  border: 1px dashed var(--color-border-strong);
  border-radius: var(--radius-md);
  padding: var(--space-12);
  text-align: center;
  cursor: pointer;
  background: var(--color-surface);
  transition: border-color var(--duration-fast) var(--ease-default),
              background-color var(--duration-fast) var(--ease-default);
}

.upload-dropzone:hover {
  border-color: var(--color-primary);
  background-color: var(--color-surface-raised);
}

/* ---------- Flash Messages ---------- */

.flash-notice {
  border-radius: var(--radius-md);
  background-color: rgba(22, 163, 74, 0.12);
  border: 1px solid rgba(22, 163, 74, 0.25);
  padding: var(--space-3) var(--space-4);
  font-size: var(--text-sm);
  color: #86EFAC;
}

.flash-alert {
  border-radius: var(--radius-md);
  background-color: rgba(34, 211, 238, 0.08);
  border: 1px solid rgba(34, 211, 238, 0.2);
  padding: var(--space-3) var(--space-4);
  font-size: var(--text-sm);
  color: var(--color-text);
}

/* ---------- Buttons ---------- */

.btn-primary {
  display: inline-flex;
  align-items: center;
  justify-content: center;
  gap: var(--space-2);
  padding: var(--space-3) var(--space-8);
  background-color: var(--color-primary);
  color: var(--color-deepest);
  font-family: var(--font-sans);
  font-size: var(--text-sm);
  font-weight: 600;
  line-height: 1;
  letter-spacing: 0.01em;
  border: 1px solid transparent;
  border-radius: var(--radius-md);
  cursor: pointer;
  text-decoration: none;
  transition: background-color var(--duration-fast) var(--ease-default),
              box-shadow var(--duration-fast) var(--ease-default);
}

.btn-primary:hover {
  background-color: var(--color-primary-hover);
}

.btn-primary:active { transform: scale(0.98); }

.btn-secondary {
  display: inline-flex;
  align-items: center;
  justify-content: center;
  gap: var(--space-2);
  padding: var(--space-3) var(--space-8);
  background-color: transparent;
  color: var(--color-primary);
  font-family: var(--font-sans);
  font-size: var(--text-sm);
  font-weight: 600;
  line-height: 1;
  letter-spacing: 0.01em;
  border: 1px solid var(--color-primary);
  border-radius: var(--radius-md);
  cursor: pointer;
  text-decoration: none;
  transition: background-color var(--duration-fast) var(--ease-default),
              color var(--duration-fast) var(--ease-default);
}

.btn-secondary:hover {
  background-color: var(--color-primary);
  color: var(--color-deepest);
}

.btn-lg {
  padding: var(--space-4) var(--space-10);
  font-size: var(--text-base);
}

.btn-sm {
  padding: var(--space-2) var(--space-5);
  font-size: var(--text-xs);
}

/* ---------- Hero ---------- */

.hero {
  background: var(--color-deepest);
  padding: var(--section-lg) 0 var(--section-sm);
  text-align: center;
  color: var(--color-text);
}

.hero h1 {
  font-family: var(--font-display);
  font-size: var(--text-display);
  font-weight: 700;
  line-height: 1.1;
  letter-spacing: -0.03em;
  margin-bottom: var(--space-6);
  color: var(--color-text);
}

.hero p {
  font-family: var(--font-sans);
  font-size: var(--text-lg);
  color: var(--color-text-secondary);
  max-width: 36rem;
  margin-left: auto;
  margin-right: auto;
  line-height: 1.6;
  text-wrap: balance;
}

/* ---------- Headings ---------- */

.heading-display {
  font-family: var(--font-display);
  font-size: var(--text-display);
  font-weight: 700;
  line-height: 1.1;
  letter-spacing: -0.03em;
  text-wrap: balance;
}

.heading-1 {
  font-family: var(--font-display);
  font-size: var(--text-3xl);
  font-weight: 700;
  line-height: 1.15;
  letter-spacing: -0.02em;
  text-wrap: balance;
}

.heading-2 {
  font-family: var(--font-display);
  font-size: var(--text-2xl);
  font-weight: 600;
  line-height: 1.2;
  letter-spacing: -0.01em;
  text-wrap: balance;
}

.heading-3 {
  font-family: var(--font-display);
  font-size: var(--text-xl);
  font-weight: 600;
  line-height: 1.25;
  text-wrap: balance;
}

.eyebrow {
  font-family: var(--font-mono);
  font-size: var(--text-xs);
  font-weight: 600;
  letter-spacing: 0.12em;
  text-transform: uppercase;
  color: var(--color-primary);
  margin-bottom: var(--space-3);
  text-wrap: balance;
}

/* ---------- Feature Grid ---------- */

.feature-grid {
  display: grid;
  grid-template-columns: repeat(1, 1fr);
  gap: var(--space-8);
}

@media (min-width: 640px) {
  .feature-grid { grid-template-columns: repeat(2, 1fr); }
}

@media (min-width: 1024px) {
  .feature-grid { grid-template-columns: repeat(3, 1fr); }
}

.feature-item { text-align: left; }

.feature-icon {
  width: 2.5rem;
  height: 2.5rem;
  display: flex;
  align-items: center;
  justify-content: center;
  background-color: rgba(34, 211, 238, 0.08);
  color: var(--color-primary);
  border-radius: var(--radius-sm);
  margin-bottom: var(--space-4);
  font-size: 1.125rem;
  border: 1px solid rgba(34, 211, 238, 0.15);
}

.feature-item h3 {
  font-family: var(--font-display);
  font-size: var(--text-lg);
  font-weight: 600;
  margin-bottom: var(--space-2);
  color: var(--color-text);
  text-wrap: balance;
}

.feature-item p {
  font-size: var(--text-base);
  line-height: 1.6;
  color: var(--color-text-secondary);
  text-wrap: balance;
}

/* ---------- Card ---------- */

.card-flat {
  background: var(--color-surface);
  border: 1px solid var(--color-border);
  border-radius: var(--radius-md);
  padding: var(--space-6);
}

/* ---------- Data Card ---------- */

.data-card {
  background: var(--color-surface);
  border: 1px solid var(--color-border);
  border-radius: var(--radius-md);
  padding: var(--space-5);
  display: flex;
  align-items: flex-start;
  gap: var(--space-4);
}

.data-card-allele {
  font-family: var(--font-mono);
  font-size: var(--text-xl);
  font-weight: 700;
  line-height: 1;
  padding: var(--space-2) var(--space-3);
  border-radius: var(--radius-sm);
  min-width: 3.5rem;
  text-align: center;
  flex-shrink: 0;
}

.data-card-body h4 {
  font-family: var(--font-display);
  font-size: var(--text-base);
  font-weight: 600;
  margin-bottom: var(--space-1);
  color: var(--color-text);
}

.data-card-body p {
  font-size: var(--text-sm);
  color: var(--color-text-secondary);
  line-height: 1.5;
}

.data-card-rsid {
  font-family: var(--font-mono);
  font-size: var(--text-xs);
  color: var(--color-muted);
}

/* ---------- Concern ---------- */

.concern-critical {
  background-color: rgba(220, 38, 38, 0.12);
  color: #FCA5A5;
  border-color: rgba(220, 38, 38, 0.3);
}

.concern-warning {
  background-color: rgba(234, 88, 12, 0.12);
  color: #FDBA74;
  border-color: rgba(234, 88, 12, 0.3);
}

.concern-caution {
  background-color: rgba(202, 138, 4, 0.12);
  color: #FDE68A;
  border-color: rgba(202, 138, 4, 0.3);
}

.concern-normal {
  background-color: rgba(22, 163, 74, 0.12);
  color: #86EFAC;
  border-color: rgba(22, 163, 74, 0.3);
}

.concern-dot {
  display: inline-block;
  width: 0.5rem;
  height: 0.5rem;
  border-radius: 50%;
  flex-shrink: 0;
}

.concern-dot-critical { background-color: #EF4444; }
.concern-dot-warning  { background-color: #F97316; }
.concern-dot-caution  { background-color: #EAB308; }
.concern-dot-normal   { background-color: #22C55E; }

/* ---------- Panels ---------- */

.panel-light {
  background-color: var(--color-surface);
  color: var(--color-text);
  padding: var(--section-md) 0;
}

.panel-natural {
  background-color: var(--color-bg);
  color: var(--color-text);
  padding: var(--section-md) 0;
}

/* ---------- Badge ---------- */

.badge {
  display: inline-flex;
  align-items: center;
  gap: var(--space-1);
  padding: var(--space-1) var(--space-3);
  font-family: var(--font-mono);
  font-size: var(--text-xs);
  font-weight: 600;
  border-radius: var(--radius-sm);
  background-color: rgba(34, 211, 238, 0.1);
  color: var(--color-primary);
  border: 1px solid rgba(34, 211, 238, 0.2);
}

.badge-cream {
  background-color: rgba(245, 158, 11, 0.1);
  color: var(--color-secondary-light);
  border-color: rgba(245, 158, 11, 0.2);
}

/* ---------- Tag ---------- */

.tag-primary {
  display: inline-block;
  padding: var(--space-1) var(--space-3);
  border-radius: var(--radius-sm);
  background-color: rgba(34, 211, 238, 0.08);
  color: var(--color-primary);
  font-size: var(--text-xs);
  font-weight: 500;
  border: 1px solid rgba(34, 211, 238, 0.15);
}

/* ---------- Evidence Badges ---------- */

.evidence-badge {
  display: inline-flex;
  align-items: center;
  gap: var(--space-1);
  padding: 2px var(--space-2);
  border-radius: var(--radius-sm);
  font-family: var(--font-mono);
  font-size: 10px;
  font-weight: 700;
  text-transform: uppercase;
  letter-spacing: 0.05em;
}

.evidence-established {
  background-color: rgba(22, 163, 74, 0.12);
  color: #86EFAC;
}

.evidence-strong {
  background-color: rgba(34, 211, 238, 0.1);
  color: #67E8F9;
}

.evidence-moderate {
  background-color: rgba(245, 158, 11, 0.1);
  color: #FDE68A;
}

.evidence-suggestive {
  background-color: rgba(148, 163, 184, 0.1);
  color: #94A3B8;
}

.evidence-replicated {
  background-color: rgba(22, 163, 74, 0.12);
  color: #86EFAC;
  border: 1px solid rgba(22, 163, 74, 0.3);
}

/* ---------- Blueprint Section ---------- */

.blueprint-section {
  background: var(--color-surface);
  border: 1px solid var(--color-border);
  border-radius: var(--radius-md);
  overflow: hidden;
  margin-bottom: var(--space-6);
}

.blueprint-header {
  display: flex;
  align-items: center;
  gap: var(--space-4);
  padding: var(--space-5) var(--space-6);
  background: var(--color-surface-raised);
  border-bottom: 1px solid var(--color-border);
}

.blueprint-header-icon {
  width: 2.5rem;
  height: 2.5rem;
  border-radius: var(--radius-sm);
  background: rgba(34, 211, 238, 0.08);
  display: flex;
  align-items: center;
  justify-content: center;
  font-size: 1.25rem;
  flex-shrink: 0;
}

.blueprint-header h3 {
  font-family: var(--font-display);
  font-size: var(--text-lg);
  font-weight: 600;
  color: var(--color-text);
}

.blueprint-body {
  padding: var(--space-6);
}

/* ---------- Prose ---------- */

.prose h1, .prose h2, .prose h3 {
  font-family: var(--font-display);
  font-weight: 600;
  margin: var(--space-4) 0 var(--space-2);
  line-height: 1.3;
  color: var(--color-text);
}
.prose h1 { font-size: var(--text-xl); }
.prose h2 { font-size: var(--text-lg); }
.prose h3 { font-size: var(--text-base); }
.prose p { margin: var(--space-2) 0; line-height: 1.65; color: var(--color-text-secondary); }
.prose ul, .prose ol { padding-left: 1.5em; margin: var(--space-2) 0; }
.prose li { margin: var(--space-1) 0; line-height: 1.5; color: var(--color-text-secondary); }
.prose strong { font-weight: 600; color: var(--color-text); }
.prose a { color: var(--color-primary); text-decoration: underline; }
.prose code {
  font-family: var(--font-mono);
  font-size: 0.9em;
  background: rgba(255,255,255,0.06);
  padding: 1px 4px;
  border-radius: 2px;
}

/* ---------- Method Notes ---------- */

.method-note {
  font-family: var(--font-mono);
  font-size: var(--text-xs);
  line-height: 1.6;
  color: var(--color-primary);
  background: rgba(34, 211, 238, 0.05);
  border-left: 2px solid rgba(34, 211, 238, 0.3);
  padding: var(--space-3) var(--space-4);
  margin-top: var(--space-3);
  margin-bottom: var(--space-3);
  border-radius: 0 var(--radius-sm) var(--radius-sm) 0;
}

.method-note-inline {
  font-family: var(--font-mono);
  font-size: 10px;
  line-height: 1;
  color: var(--color-primary);
  background: rgba(34, 211, 238, 0.08);
  padding: 2px 6px;
  border-radius: var(--radius-sm);
  white-space: nowrap;
}

/* ---------- Reduced Motion ---------- */

@media (prefers-reduced-motion: reduce) {
  * {
    transition: none !important;
    animation: none !important;
  }
}